В альтернативно существовавшей Японии уже в позапрошлом веке гейши играли на гитарах, злодеи применяли электрошок и ездили на поездах, а самураи носили эластичные трико и стреляли разрывными пулями. Словом, там всё было абсолютно не так, как мы привыкли думать. Кроме одного: борьба добра со злом протекала привычным руслом – тайный отряд «Самурай Ган» боролся с произволом, преступностью и насилием.
Пацифист Итимацу, доблестный Даймон и ослепительная Курэнай истребляли негодяев не самым самурайским – огнестрельным – способом, но зато с поистине самурайским рвением. Однако скоро их усилия навлекли на «Самурай Ган» гнев правительства, которое создало особое подразделение для борьбы с нелегальными правдолюбцами...