Setsuna, een middelbare scholier, heeft niet alleen te maken met pestkoppen en meer dan passende gevoelens voor zijn eigen zus, maar moet ook in het reine komen met het feit dat hij de reïncarnatie is van de organische engel Alexiel die in opstand kwam tegen God. Omdat hij in een wereld terechtkomt waarvan hij het bestaan niet wist, moet hij geloven dat engelen en demonen bestaan ter wille van de hemel, de aarde en zelfs de hel.